| Název projektu: |
Analýza obrazových dat z digitální patologie v prostředí e-infrastruktury CESNET |
| Řešitel: |
RNDr. Michal Růžička, Ph.D. |
| Instituce řešitele: |
MU |
| Spoluřešitel(é): |
doc. Mgr. Petr Holub, Ph.D. (MU), Bc. Marián Ďurčo (MU), Mgr. Matej Gallo (MU) |
| Ročník: |
2019/2 |
| Doba řešení projektu: |
5.12.2019 - 5.12.2020 |
| Téma: |
Pokročilé aplikace využívající e-infrastrukturu CESNET |
| Anotace: |
Cílem projektu je návrh a implementace prostředí umožňující zpracování osobních dat včetně zvláště citlivých dat dle GDPR v prostředí e-infrastruktury CESNET, použitelné pr náročné výpočetní aplikace v oblasti umělé inteligence nad medicinskými daty. Jako pilotníaplikace bude použito hluboké strojové učení konvolučních neuronových sítí nad rozsáhlými obrazovými daty z digitální patologie, tzv. whole-slide images o rozměrech až 200 000 x 100 000 bodů, v rámci výzkumné spolupráce Masarykovy univerzity a Masarykova onkologického ústavu, dvou institucí využívajících e-infrastrukturu CESNET. Jedná se o mimořádně dynamickou výzkumnou oblast a schopnost soutěžit se světovými týmy je podmíněna rozšířením výpočetních kapacit nad rámec zdrojů Masarykovy univerzity. Podávaný projekt se soustředí na škálování výpočetní infrastruktury potřebné pro strojové učení s využitím MetaCentra, což představuje netriviální problém s ohledem na ochranu osobních údajů i na technické odlišnosti mezi infrastrukturou Masarykovy univerzity a MetaCentra, a je tak komplementární k internímu projektu Masarykova onkologického ústavu zaměřenému na rozvoj samotného strojového učení s cílem zvýšit efektivitu diagnózy karcinomu prostaty. Jelikož Masarykova univerzita v současnosti pracuje také na vytvoření zabezpečené infrastruktury vhodné pro ukládání citlivých dat z oblasti life-sciences v rámci spolupráce CERIT-SC a ELIXIR, tak podávaný projekt prakticky podpoří harmonizaci procesního i technického nastavení zabezpečených prostředí mezi zdroji Masarykovy univerzity a e-infrastrukturou sdružení CESNET. |
| URL adresa projektu: |
https://fondrozvoje.cesnet.cz/projekt.aspx?ID=656 |